上海杏园瑞民生物工程有限公司

https://xybiotech.biomart.cn

公众号

扫一扫
进入手机商铺

商家诚信度:
成立时间:2014年
入驻丁香通年限:6年
商家等级:金牌客户
产品信息完整度:50%
公司新闻

结直肠癌的血小板 RNA 标志物

发布时间:2019-11-19 10:26 |  点击次数:

长期以来,人们认为血小板只是在组织损伤或血管损伤后刺激凝血。然而,目前已知,血小板通过分泌促进肿瘤增殖的蛋白质和 RNA 来促进肿瘤生长和转移。

尽管血小板中 rna 的数量较少,但研究表明,血小板具有丰富的 mRNA 序列(每个血小板约有 3000 至 6000 个 mRNA)。几项研究发现,血小板可刺激其前体 mRNA 的剪接,以响应来自癌细胞的信号,从而导致其转录组的变化,从而反映病理进展。因此,血小板 mRNA 可用于液体活检。研究表明,血小板可以吸收肿瘤细胞分泌的微囊泡中含有的肿瘤源 RNA。与目前用于液体活检的资源相比,TEP RNA 作为癌症诊断的生物标志物具有一些优势。由于血小板不含细胞核,因此不存在来自基因组 DNA 的干扰。血小板易于收集、分离和分析。血小板不断暴露于肿瘤及其环境中,与肿瘤细胞交换生物分子,形成 TEP。血小板 RNA 谱分析或直接测量血小板内肿瘤衍生的生物标志物提供了个体癌症相关过程的信息。

近期,来自江苏省肿瘤医院的研究团队血小板中的 TIMP1 mRNA 是一个潜在的、独立的诊断结直肠癌的生物标志物,并且血小板可以携带 RNAs 进入结直肠癌细胞,促进结直肠癌的发生发展。他们筛选了结直肠癌(CRC)患者和健康献血者的血小板 RNA 谱,以寻找诊断 CRC 的潜在生物标志物。在 R 中使用 WGCNA 包,他们分析了 1099 个 DEGs,包括 824 个刺激 DEGs 和 275 个抑制 DEGs,发现了 10 个 hub 基因,包括 ASAH1、C12orf76、FRMD3、SVIP、ADIPOR1、TIMP1、RAB4A、ISCU、PGRMC1 和 CALM3。他们用 qRT-PCR 检测在一个小队列中(其中包括 20 例 CRC 患者和 20 例 HVs)验证了 10 个 hub 基因。在 286 例 CRC 患者和 41 例匹配 HVs 的更大队列(验证集)中,选取差异倍数 > 2 和 P< 0.01 的 4 个受刺激的 mRNA(CALM3、TIMP1、ASAH1 和 ADIPOR1)进行进一步验证。

结果所示,在 hub 的 10 个基因中,只有一个生物标志物被验证。肿瘤患者的血小板中 TIMP1 mRNA 表达增加,而其他三种 mRNA 表达无差异。这可能需要在更大的群体中进行更多的测序和 qRT-PCR 检测,以发现潜在的因素。他们进一步使用 ROC 曲线来分析来自血小板的 TIMP1 mRNA 在 CRC 患者和 HVs 鉴别诊断中的有效性。TIMP1 mRNA 在血小板中的 ROC 曲线为 0.9583(95% CI, 0.9363-0.9803),远高于最常用的 CRC 诊断方法 CEA 和 CA199。

 

TIMP1 位于 Xp11.3-p11.23 染色体上。它的转录是一个 931 碱基对的 mRNA,编码 207 个氨基酸蛋白。该蛋白抑制基质金属蛋白酶(MMPs)的蛋白水解活性,破坏细胞外基质降解过程中基质重塑的平衡,是肿瘤侵袭转移的关键。TIMP1 也刺激癌细胞增殖和凋亡。

此外,据报道 TIMP1 降解 cyclinB1,激活 NF-kβ 信号通路,并结合 CD63 / 整合素 β1 复杂,导致抗凋亡的影响。Song 等报道 TIMP1 激活 FAK-PI3K/AKT 和 MAPK 通路,促进 CRC 进展和转移。他们发现从 CRC 的血小板中 TIMP1 mRNA 升高。然而,在癌症患者和 HVs 患者的血小板中,TIMP1 蛋白水平没有差异。健康人的血小板中几乎没有 TIMP1 mRNA,而肿瘤患者的血小板中 TIMP1 mRNA 却增加了。这一差异提示,TIMP1 mRNA 可能是在血小板成熟过程中被癌细胞诱导的,也可能被肿瘤细胞的血小板吸收。

此外,体内体外实验表明,结直肠癌患者血小板中表达的 TIMP1 mRNA 可被携带至结直肠癌细胞中,在癌细胞中被翻译成蛋白质,从而促进细胞增殖,抑制细胞凋亡。

总之,血小板中的 TIMP1 mRNA 可能作为诊断 CRC 的非侵入性生物标志物。


【引用文献】
TIMP1 mRNA in tumor-educated platelets is diagnostic biomarker for colorectal cancer
AGING 2019, Vol. 11, Advance
       
杏园生物生产的人血小板超纯分离试剂盒通过梯度离心和滤膜过滤相结合的方法,直接从人体全血样品中分离出结构完整且高纯度血小板组分。适用于人体(生理或病理)血小板的制备。其制备物产量高,制备过程可有效抑制血小板激活,纯度可达 99.99%,除可用于凝集试验、功能检测等传统研究外,还可用于实时定量 PCR、高通量测序等灵敏度高的分子实验。